秘卷的选择直接影响战斗的胜负，因此需要根据忍者特性、战斗场景和对手阵容进行综合考量。秘卷分为BUFF型、防御型、限制走位型和输出型四大类，每类秘卷的适用场景和搭配逻辑存在显著差异。BUFF型秘卷如禁术·阴愈伤灭适合缺乏自保能力的忍者，防御型秘卷如水遁·水冲波则能有效应对突进型敌人。限制走位型秘卷如雷遁·雷电击可封锁敌方行动，而输出型秘卷如火遁·烈炎弹适合需要爆发伤害的场合。
决斗场是秘卷选择的核心应用场景，需优先考虑对抗性需求。面对拥有空中技能的忍者时，扦插之术的抓取效果能有效压制迪达拉等角色；若对手以地面技能为主，风遁·风沙阵的范围控制可创造输出空间。阿飞这类A级忍者搭配木遁·扦插之术能形成炸弹包围战术，而宇智波鼬须佐能乎形态更适合携带霸体秘卷以保障奥义释放。秘卷等级提升至5级后，部分技能会产生质变，例如烈炎弹的范围扩大和伤害增幅。
副本与团队玩法中，秘卷的群体功能更为关键。小队突袭等PVE模式推荐使用水遁·水龙卷或火遁·鬼灯笼等范围伤害秘卷，可快速清理杂兵；秘境探险中罡体秘卷的减伤效果能提升生存率。需注意部分秘卷存在场景限制，如通灵·手里剑护身在狭窄地图的收益会大幅降低。每周通过组织商店和特权商店可获取秘卷碎片，建议优先兑换版本强势的雷电击、扦插等秘卷。
忍者特性与秘卷的契合度是最终决策依据。春野樱等近战忍者适合携带掌仙术·活提升续航，而手鞠等远程角色可搭配真空波增强压制力。新忍者秽土柱间专属秘卷树界降临·变化能联动技能形成高伤连招，此类特殊组合需通过实战测试优化。游戏内秘卷图鉴详细标注了每种秘卷的冷却时间和效果范围，建议结合忍者攻防节奏进行数据化比对。
